学生档案室接收档案后，便开始进入档案整理环节，流程简介如下：
1、本科新生档案的整理
档案馆接收档案后，从教务处学籍科获取新生数据，按学院、专业、学号分类排序，为每份档案编制档号，打印档案标签并粘贴到档案袋后装入档案袋。（档案整理包括：将新生履历表和入学前档案装进相应的新档案袋中、检查归档材料是否齐全完整、按档号排序放进相应的档案柜、检查档案有无错袋）
2、研究生新生档案的整理
档案馆接收研究生新生档案后，向研究生部培养管理办获取新生数据，按博士、硕士、学院、专业、学号分类排序，为每份档案编制档号，并按数据打印新生档案袋标签。整理方法与本科生的基本一致。